實驗原理
ChIP與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq技術,能夠高效地在全基因組范圍內檢測與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區(qū)段,研究體內轉錄因子和靶基因啟動子區(qū)域直接相互作用的方法,對調控蛋白在基因組上的結合靶點篩選、差異化表觀遺傳變異的原理揭示提供了重要的解決思路。
實驗步驟
適用研究
篩選調控蛋白在基因組上的結合靶點,揭示差異化表觀遺傳變異的原理,研究表觀遺傳變異疾病
樣本要求
目的基因或轉錄因子的相關背景資料;動物:細胞系、低脂肪含量組織液氮速凍樣本(細胞數(shù)大于5×106個);
樣品運輸:干冰運輸,建議用滅菌的樣品袋或LoBind 管,parafilm將管口密封好。
結果提供
ChIP-DNA:分布在100~500bp范圍,且主要片段在~250bp;總量≥5ng;Input率;
陰性對照抗體對目的片段的富集程度小于檢測抗體2倍以上。